HCA data downloads

HCA data downloads

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还记得去年看的时候还是什么都没有，今年已经有数据可以下载了．

 

官方提供的下载方式是一次下载，幸福终生，我觉得这样有点坑，毕竟是几百G甚至上T的数据，哪能说下就下ORZ.

简单看了下官方提供的下载脚本：

看到这个循环的 bundles 不由虎躯一震，怎么样也算是可以分开下载了，开熏．

简单的整理了一下脚本，可以分 uuid 进行分批下载，平行下载话怎么也能加快一些下载速度吧．

首先就是 python　的 pip　下载工具的安装:

sudo apt-get install python-pip

然后是安装HCA提供的官方下载包 {hca} :

sudo pip install hca --upgrade --ignore-installed six

最后就是根据 uuid 进行下载啦：

hca dss download --bundle-uuid c94a43f9-257f-4cd0-b2fe-eaf6d5d37d18 --replica aws

又浪费了一下午，又该滚回去写论文了．